More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1773 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  100 
 
 		 491 aa  964    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  62.76 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  50.11 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  42.37 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2375  sugar transporter  44.05 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00427288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  41.76 
 
 		 509 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  42.43 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  38.19 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  38.19 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  38.19 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  42.14 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  38.95 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  38.43 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.25 
 
 		 492 aa  296  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  38.31 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  35.18 
 
 		 480 aa  287  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  38.08 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.81 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  36.16 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.5 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  37.17 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.48 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  35.29 
 
 		 482 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.67 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  31.36 
 
 		 480 aa  266  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  36.65 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  35.32 
 
 		 473 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  34.54 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  35.62 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  35.56 
 
 		 497 aa  256  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  35.14 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  37.53 
 
 		 452 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  37.53 
 
 		 452 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  35.49 
 
 		 507 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.43 
 
 		 466 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  36.57 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.69 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  34.87 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  36.44 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.06 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.74 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  32.61 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  32.61 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  32.61 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  32.61 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  32.83 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  32.83 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  32.61 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  32.61 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  32.83 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  32.61 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  32.83 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  32.61 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.86 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  32.83 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  32.61 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.15 
 
 		 473 aa  243  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  31.74 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  35.15 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  37.7 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.68 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.19 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  37.25 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.33 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.7 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  32.7 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.7 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  32.7 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  32.7 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.8 
 
 		 450 aa  233  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.19 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.14 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  32.6 
 
 		 437 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.14 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.48 
 
 		 446 aa  230  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  32.27 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  32.06 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  28.84 
 
 		 477 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.53 
 
 		 458 aa  223  7e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  31.17 
 
 		 480 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  29.87 
 
 		 561 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.57 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  29.25 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  31.31 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  30.24 
 
 		 466 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.38 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  31.58 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  31.74 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  31.52 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  32.23 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.02 
 
 		 491 aa  207  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.02 
 
 		 491 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>