More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0479 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  71.09 
 
 
459 aa  654    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  100 
 
 
471 aa  949    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  38.89 
 
 
458 aa  303  6.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  38.14 
 
 
484 aa  302  8.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  38.12 
 
 
516 aa  285  9e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  38.11 
 
 
446 aa  279  8e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.52 
 
 
477 aa  279  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  36.08 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.03 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  33.84 
 
 
480 aa  269  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  35.92 
 
 
480 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  35.45 
 
 
450 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34.67 
 
 
463 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  36.95 
 
 
480 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.41 
 
 
450 aa  262  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  35.35 
 
 
480 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.87 
 
 
468 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.22 
 
 
463 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.68 
 
 
507 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  33.26 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  37.58 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  35.28 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  34.43 
 
 
497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  36.9 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.52 
 
 
472 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  35.45 
 
 
448 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.54 
 
 
442 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.88 
 
 
533 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.41 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.9 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  33.49 
 
 
475 aa  242  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  32.03 
 
 
466 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.07 
 
 
474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.38 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  36.71 
 
 
468 aa  239  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  32.17 
 
 
468 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  31.65 
 
 
480 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.3 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.76 
 
 
468 aa  239  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  33.55 
 
 
457 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.04 
 
 
475 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  35.52 
 
 
491 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.94 
 
 
477 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  32.44 
 
 
491 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  32.42 
 
 
467 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.21 
 
 
457 aa  226  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  32.44 
 
 
491 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  32.44 
 
 
491 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.44 
 
 
491 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.44 
 
 
491 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  33.56 
 
 
464 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  32.44 
 
 
491 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  31.69 
 
 
491 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.09 
 
 
478 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.76 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  32.14 
 
 
491 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  34.24 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  34.24 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  32.32 
 
 
487 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  32.68 
 
 
476 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  31.91 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.26 
 
 
465 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  30.44 
 
 
474 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.77 
 
 
544 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.55 
 
 
464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.55 
 
 
464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.55 
 
 
464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.55 
 
 
464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.55 
 
 
464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.77 
 
 
464 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.77 
 
 
464 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.55 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  33.26 
 
 
449 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  31.74 
 
 
552 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  33.55 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  30.61 
 
 
534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  32.65 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00260  sugar transporter, putative  32.14 
 
 
542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  33.48 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  31.88 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  30.47 
 
 
512 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  31.86 
 
 
470 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  31.54 
 
 
445 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  30.7 
 
 
438 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  33.19 
 
 
492 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  33.19 
 
 
492 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  33.19 
 
 
492 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  31.17 
 
 
471 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  31.17 
 
 
471 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  31.17 
 
 
471 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  32.28 
 
 
528 aa  209  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  30.52 
 
 
457 aa  209  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  30.04 
 
 
527 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  31.56 
 
 
485 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>