More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0827 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  100 
 
 		 450 aa  895    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  64 
 
 		 480 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  62.78 
 
 		 480 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  57.05 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  53.54 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  45.37 
 
 		 480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  47.76 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  46.24 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  45.21 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  46.31 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  46.92 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  43.43 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  41.7 
 
 		 473 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  41.7 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.89 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.73 
 
 		 492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  37.3 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.56 
 
 		 480 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  37.53 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.58 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  36.84 
 
 		 449 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  38.01 
 
 		 459 aa  276  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  36.49 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1766  D-xylose proton-symporter  38.42 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.946299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  36.02 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.48 
 
 		 484 aa  266  5e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  35.45 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  36.34 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.37 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  34.09 
 
 		 466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  37.81 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  35.7 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  34.43 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  36.81 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  33.8 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.86 
 
 		 468 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.7 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  33.33 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.21 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.53 
 
 		 533 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  33.26 
 
 		 457 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.85 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.66 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  34.78 
 
 		 491 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  33.63 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  33.63 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  33.63 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.94 
 
 		 475 aa  246  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  35.37 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  32.74 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  33.78 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.86 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.71 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.71 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.11 
 
 		 475 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  32.56 
 
 		 509 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.73 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  32.73 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  35.41 
 
 		 472 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  35.19 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  35.19 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  32.08 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  32.5 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.74 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.73 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  35.19 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  35.19 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  35.19 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  30.6 
 
 		 478 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  35.19 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  35.19 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  36.38 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  35.12 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.2 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  35.19 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.2 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  31.92 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  31.95 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  34.59 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.04 
 
 		 516 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  34.74 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  34.74 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  34.74 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  34.74 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  30.84 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.33 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  32.55 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  31.73 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  32.96 
 
 		 470 aa  223  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  32.59 
 
 		 458 aa  223  7e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>