More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0500 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  100 
 
 		 445 aa  884    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  58.69 
 
 		 443 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  53.92 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  52.05 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  47.5 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  44.47 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  44.59 
 
 		 448 aa  363  5.0000000000000005e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  46.31 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  44.99 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.88 
 
 		 448 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  41.23 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  43.46 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  34 
 
 		 475 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  33.41 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  33.99 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  32.91 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  32.91 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  32.91 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  32.91 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  32.59 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  32.23 
 
 		 524 aa  243  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.58 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  33.4 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  35.29 
 
 		 486 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  35.65 
 
 		 499 aa  239  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.23 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  35.15 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.09 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  34.08 
 
 		 468 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  35.35 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.61 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  35.51 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.76 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.49 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  35.76 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.7 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.32 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  36.83 
 
 		 479 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  33.19 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  36.64 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.59 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  35.35 
 
 		 458 aa  226  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  35.38 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.72 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.95 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.74 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.09 
 
 		 477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  34.15 
 
 		 544 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.79 
 
 		 516 aa  222  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.95 
 
 		 468 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.55 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  34.29 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  30.62 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  32.73 
 
 		 447 aa  220  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  34.37 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  32.5 
 
 		 529 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  34.31 
 
 		 450 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.11 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  33.04 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  33.33 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  33.41 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  35.5 
 
 		 494 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.63 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  30 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  34.99 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  33.33 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  31.94 
 
 		 466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  31.56 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.41 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  34.99 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  31.54 
 
 		 471 aa  212  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  32.36 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.63 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.72 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.61 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  35.24 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.39 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.39 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  31 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  33.55 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  33.64 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.39 
 
 		 472 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  34.29 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  34.29 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.39 
 
 		 472 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.39 
 
 		 472 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  34.29 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  34.96 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  33.92 
 
 		 497 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  35.54 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.54 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.39 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  31.39 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  31.17 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  33.77 
 
 		 486 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.88 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.26 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>