More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2649 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2649  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 2  100 
 
 		 536 aa  1065    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123588  normal  0.0278702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  54.32 
 
 		 529 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  41.97 
 
 		 518 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  43.42 
 
 		 524 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  32.55 
 
 		 448 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1031  putative metabolite transport protein CsbC  44.76 
 
 		 251 aa  223  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  29.85 
 
 		 448 aa  221  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  31.3 
 
 		 457 aa  220  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  31.15 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  37.01 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  37.54 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.67 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  30.5 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  29.42 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.99 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  31.97 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  29.49 
 
 		 478 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.33 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.27 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  37.84 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1032  putative transmembrane sugar transporter  50.45 
 
 		 225 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  35.11 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.55 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  27.71 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.22 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  27.33 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  28.91 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  36.28 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  31.33 
 
 		 468 aa  193  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  33.33 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.95 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  27.64 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  29.14 
 
 		 494 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  35.6 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  35.6 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  35.6 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  35.6 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.45 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  29.13 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  29.51 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  36.87 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  29.13 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  28.06 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  27.61 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  33.44 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  33.05 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.88 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  27.41 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  34.55 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  29.4 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  36.14 
 
 		 491 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.92 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  34.42 
 
 		 430 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  28.38 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  28.9 
 
 		 475 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  29.34 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  29.92 
 
 		 544 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  29.95 
 
 		 497 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  28.54 
 
 		 485 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  25.29 
 
 		 490 aa  180  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  28.8 
 
 		 470 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  28.38 
 
 		 474 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.06 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  29.56 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.54 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.3 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  28.35 
 
 		 490 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  32.35 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  28.04 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  28.77 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  33.83 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  28.08 
 
 		 492 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  28.08 
 
 		 492 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  28.08 
 
 		 492 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  34.25 
 
 		 480 aa  173  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  28.57 
 
 		 482 aa  173  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.65 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.65 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.65 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.65 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.65 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  34.69 
 
 		 465 aa  173  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  29.35 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  35.21 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  28.01 
 
 		 655 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  32.16 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  27.71 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34.25 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.04 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  27.61 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  29.59 
 
 		 472 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>