More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2467 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  100 
 
 		 453 aa  902    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  78.36 
 
 		 452 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  78.36 
 
 		 452 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  78.36 
 
 		 452 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  61.61 
 
 		 457 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  60.09 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  60.23 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  60.09 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  60.23 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  60 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  60.23 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  60.23 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  60.23 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  60.23 
 
 		 445 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  41.36 
 
 		 446 aa  319  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 439 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  38.67 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  36.32 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  36.07 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 443 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  35.25 
 
 		 452 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  36.16 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  36.43 
 
 		 468 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  36.43 
 
 		 468 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  36.2 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  36.2 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  36.2 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  34.8 
 
 		 443 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  34.8 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  34.8 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  35.9 
 
 		 457 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  34.8 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  34.8 
 
 		 443 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  34.57 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  36.53 
 
 		 442 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  34.55 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  35.37 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  33.56 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  29.66 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.35 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.65 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.55 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.47 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.79 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.14 
 
 		 459 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.63 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.85 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 508 aa  139  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 474 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.27 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.42 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.14 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 462 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 479 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 423 aa  132  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.93 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.89 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>