More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2911 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  99.55 
 
 		 445 aa  870    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  99.55 
 
 		 469 aa  868    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  98.43 
 
 		 445 aa  861    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 445 aa  870    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  100 
 
 		 445 aa  873    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 445 aa  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  99.55 
 
 		 445 aa  870    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  99.55 
 
 		 445 aa  870    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  60.23 
 
 		 453 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  61.87 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  61.42 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  61.42 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  56.18 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  52.9 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  38.32 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  38.07 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  35.32 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  35.04 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  34.88 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  34.34 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  34.34 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  38.04 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 443 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  32.21 
 
 		 480 aa  253  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  34.62 
 
 		 468 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  34.62 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  34.4 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  34.4 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  34.62 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 442 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  37.16 
 
 		 442 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  33.72 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  36.51 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  34.25 
 
 		 468 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  28.97 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.07 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.32 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  28.84 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 475 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 475 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.22 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 472 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 475 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  28.95 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.57 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  30.73 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  30.98 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  30.73 
 
 		 489 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.8 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  32.27 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.42 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 459 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.48 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.15 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.51 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 485 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>