More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1434 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  100 
 
 
460 aa  893    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  57.46 
 
 
458 aa  468  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  54.69 
 
 
456 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  41.28 
 
 
442 aa  311  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  35.19 
 
 
451 aa  263  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  36.7 
 
 
452 aa  256  8e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  38.18 
 
 
465 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.27 
 
 
471 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  33.62 
 
 
467 aa  219  6e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
477 aa  219  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  31.85 
 
 
459 aa  216  7e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  32.21 
 
 
469 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  33.99 
 
 
443 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  33.48 
 
 
441 aa  203  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  33.11 
 
 
442 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  33.11 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  32.33 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  30.74 
 
 
476 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  30.6 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  27.88 
 
 
555 aa  150  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
465 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.64 
 
 
465 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
423 aa  143  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  31.66 
 
 
457 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  29.45 
 
 
464 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.67 
 
 
427 aa  133  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  28.32 
 
 
446 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.2 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
460 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  27.83 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  25.77 
 
 
555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.31 
 
 
485 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  29.93 
 
 
458 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  29.93 
 
 
458 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.78 
 
 
487 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  32.49 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  32.04 
 
 
445 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 
469 aa  120  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  32.04 
 
 
445 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  32.04 
 
 
445 aa  120  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  32.04 
 
 
445 aa  120  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  32.04 
 
 
445 aa  120  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.18 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.95 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
451 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.53 
 
 
449 aa  116  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.46 
 
 
447 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.85 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
459 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
450 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.25 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.25 
 
 
487 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  27.29 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  27.29 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.26 
 
 
485 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.51 
 
 
453 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  27.82 
 
 
439 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.03 
 
 
487 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.33 
 
 
485 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
435 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.57 
 
 
474 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
445 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
451 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  30.47 
 
 
465 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.53 
 
 
480 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
443 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  23.76 
 
 
508 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.06 
 
 
477 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.39 
 
 
438 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  27.97 
 
 
442 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  27.81 
 
 
442 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
443 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.69 
 
 
434 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.89 
 
 
485 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.17 
 
 
437 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.5 
 
 
443 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
443 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  26.18 
 
 
493 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
473 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
443 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  29.54 
 
 
454 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.5 
 
 
443 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
443 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.5 
 
 
443 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01612  phosphate transporter (AFU_orthologue; AFUA_4G09210)  31.44 
 
 
664 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0276272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  23.93 
 
 
468 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  23.93 
 
 
468 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.18 
 
 
445 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  23.93 
 
 
468 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  27.73 
 
 
452 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  27.95 
 
 
452 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
470 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  27.73 
 
 
452 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  23.93 
 
 
468 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  23.93 
 
 
468 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.29 
 
 
462 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.9 
 
 
450 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
458 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  28.12 
 
 
469 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>