More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1373 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  77.5 
 
 		 442 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  873    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  71.04 
 
 		 442 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  70.36 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  45.85 
 
 		 464 aa  362  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  42.05 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  40.32 
 
 		 452 aa  312  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  38.86 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  38.32 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  38.64 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  37.7 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  38.67 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  38.67 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  38.67 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  38.44 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  38.44 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  38.44 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  37.99 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  37.99 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  37.99 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  37.76 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  37.76 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  36.79 
 
 		 452 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 452 aa  286  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  38.1 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  37.87 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  37.87 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  37.87 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  37.87 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  37.87 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  37.83 
 
 		 457 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  36.09 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  31.15 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.51 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.2 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  31.19 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.69 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.48 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.26 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  29.44 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.73 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.87 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.52 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.75 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  30.08 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.74 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  30.48 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.91 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.45 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 479 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.5 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 487 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  27.59 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.4 
 
 		 485 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 457 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  27.83 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>