More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1432 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  100 
 
 
489 aa  956    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  99.8 
 
 
489 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  79.07 
 
 
475 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  100 
 
 
489 aa  956    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  99.59 
 
 
489 aa  951    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  79.19 
 
 
475 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  79.19 
 
 
475 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  79.19 
 
 
475 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  53.15 
 
 
514 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  53.93 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  51.38 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  48.83 
 
 
496 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  30.09 
 
 
454 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  32.14 
 
 
478 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  33.33 
 
 
507 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  30.54 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  30.54 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  33.06 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  32 
 
 
482 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
478 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  29.89 
 
 
471 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  31.91 
 
 
484 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.45 
 
 
476 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.41 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.85 
 
 
480 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  28.94 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  31.04 
 
 
470 aa  139  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  28.67 
 
 
457 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
460 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.72 
 
 
443 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
443 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
443 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.72 
 
 
443 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.72 
 
 
443 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
443 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.23 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  28.6 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  31.22 
 
 
445 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
469 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  30.98 
 
 
445 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  31.22 
 
 
445 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  31.22 
 
 
445 aa  130  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  31.22 
 
 
445 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  29.1 
 
 
453 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  31.22 
 
 
445 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.42 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  31.22 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.42 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.42 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.42 
 
 
468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.42 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.2 
 
 
452 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.2 
 
 
452 aa  126  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.2 
 
 
452 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.23 
 
 
452 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  29.43 
 
 
457 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.24 
 
 
438 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.08 
 
 
427 aa  124  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.51 
 
 
474 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.85 
 
 
460 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
477 aa  120  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.32 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
472 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  27.31 
 
 
442 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  29.02 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.45 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.22 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.86 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
451 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  26.12 
 
 
447 aa  113  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.23 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.33 
 
 
463 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.79 
 
 
457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  29.21 
 
 
458 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  27.61 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  29.21 
 
 
458 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.19 
 
 
477 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
460 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.75 
 
 
459 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
451 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
423 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.16 
 
 
473 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  27.59 
 
 
464 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  29.9 
 
 
474 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  29.9 
 
 
474 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  29.9 
 
 
468 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  29.9 
 
 
468 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.7 
 
 
487 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.7 
 
 
485 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  29.9 
 
 
468 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
459 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  29.9 
 
 
468 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  28.81 
 
 
449 aa  106  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>