More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3554 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  100 
 
 		 443 aa  885    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  68.05 
 
 		 445 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  885    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  86.33 
 
 		 468 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  86.1 
 
 		 468 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  86.33 
 
 		 468 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  99.77 
 
 		 443 aa  884    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  885    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  86.33 
 
 		 468 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  99.55 
 
 		 443 aa  881    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  885    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  86.1 
 
 		 468 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  99.77 
 
 		 443 aa  884    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  100 
 
 		 443 aa  885    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  69.77 
 
 		 452 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  67.36 
 
 		 438 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  61.42 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  50.81 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  42.92 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  42.89 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  39.37 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  39.73 
 
 		 442 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 453 aa  259  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  36.74 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  34.34 
 
 		 445 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 445 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 469 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  34.34 
 
 		 445 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 445 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 445 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  34.34 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  34.11 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  33.03 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  27.31 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 434 aa  172  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  33.83 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.39 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  32.94 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  32.94 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  28.19 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.87 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.73 
 
 		 463 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  25.84 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  27.42 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  24.89 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  24.89 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  28.18 
 
 		 443 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  28.18 
 
 		 441 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  29.27 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  27 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  27.62 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 508 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.5 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  28.31 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25.11 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.5 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.95 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  27.94 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  26.77 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  26.77 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.43 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  27.07 
 
 		 442 aa  129  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.42 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 479 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  25.71 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  24.73 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 489 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  27.72 
 
 		 489 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.33 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  26.83 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>