More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0712 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  100 
 
 
463 aa  916    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
423 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.42 
 
 
476 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  29.66 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.18 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  29.25 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  29.16 
 
 
438 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  30.65 
 
 
471 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  31 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  32.6 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  29.54 
 
 
477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
477 aa  163  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  30.21 
 
 
452 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.19 
 
 
471 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  30.32 
 
 
446 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.6 
 
 
480 aa  156  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.35 
 
 
468 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.35 
 
 
468 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.35 
 
 
468 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.35 
 
 
468 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  28.6 
 
 
467 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.13 
 
 
468 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.07 
 
 
473 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  29.84 
 
 
464 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  30.32 
 
 
458 aa  150  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  30.32 
 
 
458 aa  150  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
443 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.09 
 
 
474 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.73 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.15 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.73 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.73 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.73 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.73 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.73 
 
 
443 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.1 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  29.74 
 
 
458 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.35 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.11 
 
 
474 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  27.98 
 
 
477 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  28.25 
 
 
459 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  30.63 
 
 
442 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  30.29 
 
 
460 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  28.32 
 
 
469 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.96 
 
 
455 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  31.08 
 
 
458 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  27.62 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.17 
 
 
499 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.6 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  28.89 
 
 
441 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
478 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.91 
 
 
447 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  32.74 
 
 
458 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.38 
 
 
478 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  29.12 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.23 
 
 
485 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.46 
 
 
485 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.55 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.2 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
472 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.56 
 
 
472 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.8 
 
 
455 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  26.01 
 
 
485 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  28.96 
 
 
446 aa  133  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.32 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.99 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  26.2 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.9 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.42 
 
 
459 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  25.98 
 
 
472 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  25.98 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  25.98 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  26.2 
 
 
475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  25.98 
 
 
472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  27.01 
 
 
457 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  27.8 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  30.75 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.2 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.2 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  26.72 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  25.87 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.39 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  28.48 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
460 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  27.69 
 
 
493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  29.01 
 
 
442 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>