More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1598 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  100 
 
 		 456 aa  884    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  54.22 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  48.21 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  35.45 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  37.93 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  33.63 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  32.33 
 
 		 471 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  32.84 
 
 		 467 aa  216  9e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  35.43 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  32.83 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  32.14 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  32.14 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  32.57 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  33.41 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  30.58 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  30.58 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.23 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  30.98 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  30.04 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  26.92 
 
 		 555 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  26.77 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.65 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.83 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.79 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.79 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  26.79 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  26.79 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.79 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 460 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.91 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.45 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  29.26 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  29.26 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.41 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.23 
 
 		 462 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  24.38 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.87 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  24.27 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.53 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  29.59 
 
 		 445 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.44 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  27.55 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.95 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 459 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  28.76 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  28.83 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  28.83 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.18 
 
 		 474 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  29.09 
 
 		 452 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.45 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.74 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  25.05 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  28.78 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>