More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5576 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  90.52 
 
 
425 aa  769    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  96.99 
 
 
433 aa  840    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  100 
 
 
432 aa  859    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  97.22 
 
 
432 aa  841    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  97.22 
 
 
432 aa  840    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  97.69 
 
 
432 aa  845    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  97.22 
 
 
433 aa  836    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  96.3 
 
 
432 aa  833    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  97.22 
 
 
433 aa  842    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  94.91 
 
 
432 aa  796    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  97.22 
 
 
433 aa  842    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  42.93 
 
 
418 aa  348  8e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  41.16 
 
 
491 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  40.86 
 
 
415 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  39.67 
 
 
415 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  39.52 
 
 
412 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  39.19 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  38.72 
 
 
415 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  40.38 
 
 
415 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  39.16 
 
 
410 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  39.9 
 
 
415 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  39.9 
 
 
415 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  37.41 
 
 
410 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  39.11 
 
 
408 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  36.58 
 
 
412 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
410 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  39.68 
 
 
418 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  33.56 
 
 
423 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  30.39 
 
 
415 aa  236  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.91 
 
 
435 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
419 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  30.63 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  31.38 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  30.9 
 
 
420 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  30.9 
 
 
420 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  30.9 
 
 
420 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
430 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  31.09 
 
 
434 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.34 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.82 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  30.86 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  29.88 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  30.21 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.88 
 
 
432 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  29.95 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.51 
 
 
428 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.65 
 
 
432 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.65 
 
 
432 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.3 
 
 
409 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.51 
 
 
428 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.3 
 
 
409 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  31.83 
 
 
409 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  32.63 
 
 
474 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
436 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  32.63 
 
 
474 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  32.63 
 
 
474 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  29.91 
 
 
423 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  32.63 
 
 
457 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  32.63 
 
 
457 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  29.95 
 
 
423 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  32.17 
 
 
474 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.07 
 
 
436 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  32.17 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  30.5 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  31.54 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.86 
 
 
447 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.83 
 
 
425 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.83 
 
 
425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  27.25 
 
 
411 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
428 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  30.83 
 
 
427 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  30.83 
 
 
427 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.23 
 
 
423 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 
451 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  27.7 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.27 
 
 
429 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.3 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  30.75 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.99 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.14 
 
 
424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  27.93 
 
 
429 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.14 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
415 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
415 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  31.22 
 
 
399 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  27.21 
 
 
424 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
404 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  31.06 
 
 
399 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
434 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  31.06 
 
 
399 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  31.06 
 
 
399 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  27.46 
 
 
429 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  31.06 
 
 
399 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  31.06 
 
 
399 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.82 
 
 
399 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.88 
 
 
399 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  29.24 
 
 
451 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  30.59 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  29.18 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>