More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1920 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
423 aa  843    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  42.37 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  34.03 
 
 
432 aa  252  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  34.4 
 
 
433 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  33.8 
 
 
432 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  33.89 
 
 
432 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  33.8 
 
 
432 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  33.8 
 
 
433 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  33.8 
 
 
433 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  32.79 
 
 
425 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  33.56 
 
 
433 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
432 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  34.68 
 
 
415 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  34.13 
 
 
418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  35.71 
 
 
491 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34.68 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  35.1 
 
 
415 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  36.07 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  34.27 
 
 
432 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  34.85 
 
 
415 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  34.27 
 
 
412 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  34.94 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  34.94 
 
 
415 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  37.02 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.94 
 
 
415 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  33.17 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  36.04 
 
 
418 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 
410 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  34.13 
 
 
410 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.34 
 
 
435 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  31.04 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  31.01 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  31.16 
 
 
432 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.41 
 
 
432 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  31.16 
 
 
432 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  31.16 
 
 
432 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  30.98 
 
 
423 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  31.11 
 
 
423 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  31.35 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  30.07 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  30.17 
 
 
428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  31.08 
 
 
428 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.67 
 
 
409 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.67 
 
 
409 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  28.43 
 
 
428 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  28.43 
 
 
428 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  29.57 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  28.84 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  31.08 
 
 
423 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  31.38 
 
 
436 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 
429 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
430 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  30.46 
 
 
425 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  30.46 
 
 
425 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  29.46 
 
 
429 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  28.78 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  24.82 
 
 
424 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  25.42 
 
 
424 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  25.42 
 
 
424 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
406 aa  151  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
398 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  26.2 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  25.25 
 
 
429 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.46 
 
 
399 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  27.85 
 
 
429 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
404 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  27.83 
 
 
420 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
398 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
399 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.27 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
399 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.75 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.75 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.75 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.75 
 
 
399 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  26.55 
 
 
416 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
419 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  28.11 
 
 
421 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  28.53 
 
 
419 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
451 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
415 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
415 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  29.61 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
399 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.53 
 
 
427 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  27.16 
 
 
423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.51 
 
 
427 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  27.51 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  30.68 
 
 
436 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>