More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1295 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  845    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  98.11 
 
 		 424 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  98.11 
 
 		 424 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  85.48 
 
 		 428 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  91.04 
 
 		 429 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  65.22 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  65.22 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  65.69 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  64.35 
 
 		 416 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  64.25 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  62.14 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  59.81 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  59.81 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  59.81 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  59.81 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  59.58 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  59.58 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  58.55 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  59.35 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  58.69 
 
 		 445 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  61.39 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  58.45 
 
 		 428 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  58.45 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  57.31 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  59.19 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  59.19 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  59.19 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  51.92 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  49.39 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  53.17 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 409 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  48.43 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  50.24 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  48.91 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  48.79 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  49.27 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 420 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 436 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  48.78 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  47.92 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  54.19 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  46.99 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 436 aa  325  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.35 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.34 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  35 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.6 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 425 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 416 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.91 
 
 		 433 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  34.01 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>