More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5191 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  858    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  76.46 
 
 
435 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  75.7 
 
 
474 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  75.7 
 
 
474 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  75.47 
 
 
474 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  75.7 
 
 
457 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  75.47 
 
 
474 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  75.23 
 
 
474 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  75.7 
 
 
457 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  74.51 
 
 
416 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  72.99 
 
 
415 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  72.99 
 
 
415 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  68.05 
 
 
434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  62.97 
 
 
429 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  61.68 
 
 
445 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  61.68 
 
 
445 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  61.68 
 
 
428 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  64.51 
 
 
421 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  63.75 
 
 
429 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  62.92 
 
 
428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  63.14 
 
 
423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  64.25 
 
 
424 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  64.25 
 
 
424 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  64.25 
 
 
424 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  62.56 
 
 
432 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
398 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
398 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  61.65 
 
 
398 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  53.37 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  53.37 
 
 
432 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  53.37 
 
 
432 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  53.12 
 
 
432 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  53.38 
 
 
435 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  53 
 
 
434 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  54.5 
 
 
427 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  52.96 
 
 
434 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  53.06 
 
 
409 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  51.46 
 
 
428 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  53.3 
 
 
409 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  50.98 
 
 
428 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  50.98 
 
 
428 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  51.71 
 
 
428 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  51.34 
 
 
428 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 
433 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  53.04 
 
 
423 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  51.33 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  53.04 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  53.43 
 
 
436 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  50.36 
 
 
420 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  50.36 
 
 
420 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  51.84 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  50.36 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  51.83 
 
 
409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  50.24 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  49.28 
 
 
429 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  47.13 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  49.39 
 
 
411 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  51.11 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  54.17 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  49.03 
 
 
430 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  47.1 
 
 
423 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  49.88 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  46.97 
 
 
419 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  49.88 
 
 
425 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  46.99 
 
 
419 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  55.77 
 
 
411 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  49.39 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
423 aa  342  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  45.19 
 
 
433 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  48.2 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  43.26 
 
 
441 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  41.71 
 
 
428 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  39.76 
 
 
436 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  40.09 
 
 
428 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.8 
 
 
418 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.44 
 
 
415 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34.43 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  34.68 
 
 
415 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  35.44 
 
 
415 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  33.17 
 
 
412 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  35.44 
 
 
415 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  35.44 
 
 
415 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  34.43 
 
 
415 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  31.37 
 
 
491 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  34.8 
 
 
410 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.68 
 
 
410 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
410 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
451 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.58 
 
 
432 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  33.58 
 
 
418 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  32.84 
 
 
408 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.58 
 
 
433 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
432 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.58 
 
 
432 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
433 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.18 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  32.66 
 
 
412 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>