More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4812 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  66.74 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  66.51 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  66.28 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  69.16 
 
 		 434 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  66.51 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  69.64 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  67.8 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  64.15 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  64.83 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  65.05 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  64.35 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  65.05 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  62.91 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  62.91 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  58.58 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  59.28 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  56.91 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  56.51 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  56.38 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  56.86 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  56.27 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  56.51 
 
 		 409 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  55.64 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  54.9 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  53.4 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  53.53 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  53.53 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  53.51 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  53.51 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 434 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  52.81 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  51.69 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  50.36 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  51.82 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  50.61 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  51.34 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  51.82 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 474 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  52.2 
 
 		 435 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  50.48 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  49.41 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  54.28 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  51.81 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  51.44 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  51.44 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  51.44 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  40 
 
 		 428 aa  303  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  34.8 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  33 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  33.98 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  29.93 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.71 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>