More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7578 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  100 
 
 
415 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  96.14 
 
 
415 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  89.4 
 
 
415 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  95.9 
 
 
415 aa  750    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  95.9 
 
 
415 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  77.94 
 
 
415 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  77.7 
 
 
415 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  76.43 
 
 
491 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  76.76 
 
 
418 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  69.21 
 
 
410 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  67.96 
 
 
410 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  68.97 
 
 
410 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  65.54 
 
 
412 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  64.11 
 
 
412 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  68.89 
 
 
408 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  46.33 
 
 
418 aa  376  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  40.86 
 
 
432 aa  336  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  41.09 
 
 
432 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  41.09 
 
 
433 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  41.09 
 
 
433 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  41.09 
 
 
432 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  41.09 
 
 
433 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  41.09 
 
 
432 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  41.09 
 
 
433 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  41.3 
 
 
432 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  40.38 
 
 
425 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  40.86 
 
 
432 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  34.68 
 
 
415 aa  249  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  34.68 
 
 
423 aa  241  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  36.19 
 
 
432 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  35.96 
 
 
432 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  34.88 
 
 
432 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  35.1 
 
 
432 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  35.14 
 
 
435 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  35.25 
 
 
434 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  35.07 
 
 
434 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  37.62 
 
 
433 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  37.34 
 
 
428 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  35.62 
 
 
428 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  35.35 
 
 
441 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  35.79 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  35.79 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  35.79 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  34.45 
 
 
423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
423 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
436 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  35.62 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  33.41 
 
 
423 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  35.2 
 
 
409 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  35.11 
 
 
428 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  34.95 
 
 
409 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  36.15 
 
 
420 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  36.15 
 
 
420 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  35.64 
 
 
420 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
430 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  35.9 
 
 
420 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  35.64 
 
 
420 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  34.33 
 
 
411 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  35.18 
 
 
427 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
434 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 
419 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  35.31 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  33.25 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  36.55 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  32.41 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  35.29 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  36.48 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  36.48 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  33.08 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  35.44 
 
 
430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  33.5 
 
 
425 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  33.5 
 
 
425 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  35.71 
 
 
424 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  33.75 
 
 
423 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  34.56 
 
 
474 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  34.43 
 
 
436 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  34.31 
 
 
474 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
474 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
474 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
457 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
474 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  34.07 
 
 
457 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  35.55 
 
 
435 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  35.09 
 
 
429 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 
415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 
415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  32.77 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
433 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  34.1 
 
 
428 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  35.62 
 
 
421 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  31.21 
 
 
429 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  33.76 
 
 
416 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
398 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
398 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
398 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  34.01 
 
 
432 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  29.98 
 
 
421 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>