More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5752 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  98.82 
 
 		 425 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  839    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  63.64 
 
 		 409 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  63.3 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  63.3 
 
 		 409 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  54.18 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  54.3 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  53.92 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 411 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  53.32 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  53.94 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  51.76 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  51.84 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  49.64 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  52.45 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  51.91 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  53.51 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  53.1 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  51.65 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  50 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  50.6 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  50.36 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  50.36 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  50.36 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  48.48 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  48.48 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  48.48 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  48.48 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  48.24 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  48.01 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  47.78 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  49.75 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  50.77 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  50.77 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  50.77 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  47.19 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  46.45 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  51.48 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  46.57 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 436 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  32.2 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.94 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.94 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.94 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.34 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  32.69 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  31.41 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  31.76 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>