More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5683 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  77.94 
 
 		 415 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  77.46 
 
 		 415 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  99.04 
 
 		 415 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  79.14 
 
 		 415 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  79.14 
 
 		 415 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  78.42 
 
 		 415 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  73.77 
 
 		 491 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  73.92 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  68.55 
 
 		 410 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  64.07 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  64.95 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  66.34 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  64.45 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  67.35 
 
 		 408 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  44.92 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  38.21 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  38.68 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  37.74 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  37.74 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  37.74 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  37.82 
 
 		 432 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  39.19 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  33.33 
 
 		 415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  34.85 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  36 
 
 		 432 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  33.33 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 441 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 420 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  33.67 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 409 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 428 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  32.7 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  36.92 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  34.02 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  33.64 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  33.18 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  33.18 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  33.18 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  33.18 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  33.76 
 
 		 424 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  32.94 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  33.08 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  29.93 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  29.93 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  29.93 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  30.49 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.69 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>