More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01910 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  100 
 
 		 418 aa  818    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  76.76 
 
 		 415 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  75.06 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  76.07 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  76.03 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  76.27 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  76.07 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  76.27 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  70.14 
 
 		 491 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  68.04 
 
 		 410 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  67.65 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  69.61 
 
 		 410 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  62.09 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  71.79 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  63.59 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  43.48 
 
 		 418 aa  358  9e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  40 
 
 		 432 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  39.82 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  39.82 
 
 		 433 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  39.82 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  38.9 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  39.82 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  39.91 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  32.91 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  35.95 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  34.34 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 420 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 420 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 432 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 432 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 423 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  32.7 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  35 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 		 429 aa  209  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  34.44 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  33.99 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  33.74 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  35.03 
 
 		 435 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  35.04 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  29.68 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  29.68 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  29.68 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.9 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  28.9 
 
 		 427 aa  163  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  29.52 
 
 		 398 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>