More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0350 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  99.12 
 
 
457 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  99.16 
 
 
474 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  99.12 
 
 
457 aa  890    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  100 
 
 
474 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  84.9 
 
 
435 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  99.16 
 
 
474 aa  923    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  98.95 
 
 
474 aa  921    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  99.37 
 
 
474 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  75.06 
 
 
430 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  70.79 
 
 
416 aa  571  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  69.86 
 
 
415 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  69.86 
 
 
415 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  63.43 
 
 
434 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  61.73 
 
 
429 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  63.23 
 
 
428 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  63.23 
 
 
445 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  63.23 
 
 
445 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  63.45 
 
 
421 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  59.13 
 
 
423 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  60.32 
 
 
432 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  59.67 
 
 
429 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  63.57 
 
 
398 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  58.5 
 
 
424 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  63.57 
 
 
398 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  63.57 
 
 
398 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  58.28 
 
 
424 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  59.3 
 
 
424 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  58.97 
 
 
428 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  52.17 
 
 
432 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  52.4 
 
 
432 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  52 
 
 
432 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  51.86 
 
 
432 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  49.66 
 
 
435 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  52.2 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  51.97 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  48.13 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  51.41 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
433 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  46.19 
 
 
428 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  48.24 
 
 
428 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  47.66 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  47.9 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  47.94 
 
 
420 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  48.36 
 
 
423 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  46.64 
 
 
429 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  48.36 
 
 
423 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  48.36 
 
 
409 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  45.15 
 
 
429 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  47.48 
 
 
420 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  48.12 
 
 
409 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  47.48 
 
 
420 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  47.48 
 
 
420 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  47.47 
 
 
420 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 
430 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  46.14 
 
 
411 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 
436 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  46.84 
 
 
409 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  46.42 
 
 
434 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  45.39 
 
 
423 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  48.24 
 
 
425 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  48.24 
 
 
425 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  45.54 
 
 
419 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 
428 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  48.04 
 
 
437 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  55.42 
 
 
411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  47.34 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
423 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  40.31 
 
 
428 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  41.45 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  40.96 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  44.44 
 
 
436 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  41.76 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  39.08 
 
 
428 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  30.99 
 
 
418 aa  204  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  33.01 
 
 
491 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  32.33 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  32.33 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  31.15 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.86 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  31.86 
 
 
432 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  34.23 
 
 
415 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  30.91 
 
 
433 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  31.86 
 
 
433 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  32.09 
 
 
432 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  32.09 
 
 
432 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
451 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  33.74 
 
 
415 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  33.9 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  31.23 
 
 
425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  33.82 
 
 
415 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  34.53 
 
 
410 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  33.49 
 
 
410 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  34.96 
 
 
415 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
410 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  34.96 
 
 
415 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  34.96 
 
 
415 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  34.05 
 
 
408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  30.86 
 
 
432 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.44 
 
 
412 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>