More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1616 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  79.95 
 
 
445 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  80.19 
 
 
445 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  80.43 
 
 
428 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  100 
 
 
432 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  80.48 
 
 
429 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  81.23 
 
 
398 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  81.23 
 
 
398 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  81.23 
 
 
398 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  73.33 
 
 
423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  64.63 
 
 
415 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  64.63 
 
 
415 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  60.8 
 
 
474 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  60.56 
 
 
474 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  60.09 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  62.93 
 
 
416 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  60.09 
 
 
474 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  60.09 
 
 
457 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  61.5 
 
 
435 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  60.09 
 
 
457 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  60.09 
 
 
474 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  62.56 
 
 
430 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  61.48 
 
 
434 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  60.29 
 
 
421 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  57.79 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  56.13 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  54.88 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  57.49 
 
 
424 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  57.31 
 
 
424 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  50.36 
 
 
429 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  49.76 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  49.16 
 
 
429 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  50.24 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  50.12 
 
 
428 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  49.76 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  51.46 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  50.85 
 
 
427 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  50.73 
 
 
411 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  49.76 
 
 
409 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  48.79 
 
 
428 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  49.51 
 
 
409 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  50.72 
 
 
432 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  50.72 
 
 
432 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  50.12 
 
 
432 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  50.85 
 
 
432 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  50 
 
 
423 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  50.48 
 
 
435 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  50.24 
 
 
423 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  51.21 
 
 
425 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  50.97 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  51.45 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  51.21 
 
 
425 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  47.9 
 
 
423 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 
430 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  48.54 
 
 
409 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  49.28 
 
 
420 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 
428 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  48.56 
 
 
420 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  48.56 
 
 
420 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  48.56 
 
 
420 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  47.96 
 
 
420 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  47.51 
 
 
434 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 
419 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  46.17 
 
 
419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  46.23 
 
 
436 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  46.97 
 
 
429 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  46.96 
 
 
437 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  54.22 
 
 
411 aa  338  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
423 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  46.23 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  40.84 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  42.59 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  40.28 
 
 
428 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  39.95 
 
 
428 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  38.53 
 
 
436 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  30.77 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
451 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.51 
 
 
418 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  34.01 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  32.1 
 
 
491 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  31.74 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  31.68 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.49 
 
 
410 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  30.83 
 
 
415 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  30.96 
 
 
412 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  34.18 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  34.18 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  33.67 
 
 
415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  32.75 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.81 
 
 
433 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  32.74 
 
 
410 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.64 
 
 
432 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29 
 
 
425 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
432 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
410 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.68 
 
 
433 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.38 
 
 
432 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.12 
 
 
432 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.12 
 
 
433 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.12 
 
 
433 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.15 
 
 
432 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>