More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2187 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  96.63 
 
 
416 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
416 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  64.1 
 
 
420 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  63.85 
 
 
406 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  63.59 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  63.33 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  63.33 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  63.33 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  63.33 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  63.08 
 
 
406 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  62.31 
 
 
406 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  62 
 
 
408 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  62 
 
 
408 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  62 
 
 
408 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  62 
 
 
406 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  62 
 
 
408 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  62.82 
 
 
408 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  62 
 
 
408 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  62 
 
 
408 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  60.9 
 
 
407 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
417 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
417 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  57.14 
 
 
410 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
417 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 
417 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  53.2 
 
 
417 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  48.98 
 
 
407 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  49.27 
 
 
422 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
430 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  40.49 
 
 
542 aa  282  7.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  35.07 
 
 
493 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  35.4 
 
 
495 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  33.82 
 
 
514 aa  233  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  41.5 
 
 
547 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  31.72 
 
 
520 aa  179  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  35.23 
 
 
431 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  33.8 
 
 
428 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  32.96 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  32.04 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  31.25 
 
 
423 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  32.96 
 
 
424 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  32.96 
 
 
424 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  32.96 
 
 
424 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  33.43 
 
 
409 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  33.43 
 
 
409 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  34.52 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  30.11 
 
 
429 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  30.99 
 
 
425 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.17 
 
 
429 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  31.86 
 
 
409 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  30.99 
 
 
425 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.08 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.08 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
411 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
436 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.08 
 
 
405 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
423 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  32.58 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  31.13 
 
 
427 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  32.09 
 
 
428 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  31.58 
 
 
467 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  32.78 
 
 
432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.92 
 
 
412 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  31.08 
 
 
420 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.02 
 
 
435 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.28 
 
 
436 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  31.81 
 
 
410 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
434 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  31.12 
 
 
415 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  31.97 
 
 
429 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
428 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  29.87 
 
 
395 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.299198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  33.24 
 
 
437 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  30.81 
 
 
420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  30.63 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  30.83 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
474 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
474 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
474 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  29.64 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  31.23 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  31.23 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  31.23 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  30.79 
 
 
491 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  33.89 
 
 
421 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  30.63 
 
 
434 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
482 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  30.27 
 
 
420 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  29.82 
 
 
415 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.28 
 
 
432 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  30.53 
 
 
435 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  30.27 
 
 
420 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  30.27 
 
 
420 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  30.57 
 
 
415 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>