More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4365  cis,cis-muconate transporter MucK  87.72 
 
 
450 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  100 
 
 
451 aa  900    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  59.25 
 
 
427 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  59.57 
 
 
427 aa  524  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  47.88 
 
 
421 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  48.11 
 
 
421 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
422 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.46 
 
 
432 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.24 
 
 
432 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.13 
 
 
433 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.16 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.73 
 
 
433 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.52 
 
 
435 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  30 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  30.19 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  29.52 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  30 
 
 
433 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.73 
 
 
432 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  30 
 
 
432 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.73 
 
 
433 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  30.85 
 
 
491 aa  166  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.52 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  32.98 
 
 
423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  32.98 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  28.38 
 
 
432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  30.46 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.45 
 
 
436 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  32.09 
 
 
415 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  30.45 
 
 
432 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  31.63 
 
 
428 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.64 
 
 
432 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.77 
 
 
428 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  31.09 
 
 
412 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.77 
 
 
428 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.52 
 
 
428 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.77 
 
 
428 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.23 
 
 
415 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  30.99 
 
 
427 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.93 
 
 
418 aa  156  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
423 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
451 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  29.23 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  28.61 
 
 
424 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.33 
 
 
424 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  29.17 
 
 
441 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  31.63 
 
 
433 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.33 
 
 
424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  27.94 
 
 
445 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  27.94 
 
 
445 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  27.94 
 
 
428 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  31.86 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
474 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
474 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.95 
 
 
457 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  30 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  30.26 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  29.75 
 
 
415 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  26.76 
 
 
429 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  29.18 
 
 
425 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  30.85 
 
 
415 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  30.85 
 
 
415 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.71 
 
 
408 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.93 
 
 
447 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.3 
 
 
425 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  30.6 
 
 
415 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  29.2 
 
 
420 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.39 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  28.35 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.39 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.39 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  31.46 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.19 
 
 
430 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
399 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.64 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.64 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  30.1 
 
 
435 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  30.96 
 
 
410 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
398 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
398 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
398 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  30.53 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
398 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
398 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.01 
 
 
409 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
451 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.22 
 
 
438 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.33 
 
 
455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  28.87 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>