More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1618 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  100 
 
 
458 aa  903    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  42.54 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  40.61 
 
 
469 aa  315  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  41.68 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  42.34 
 
 
467 aa  309  9e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 
477 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  41.18 
 
 
465 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  37.1 
 
 
443 aa  263  6e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  37.1 
 
 
441 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  37.69 
 
 
442 aa  257  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  37.47 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  33.54 
 
 
555 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  31.5 
 
 
555 aa  233  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  35.93 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  34.39 
 
 
458 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  32.33 
 
 
460 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  30.13 
 
 
442 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.48 
 
 
427 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  31.36 
 
 
471 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  33.18 
 
 
456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
423 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  31.62 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  27.8 
 
 
452 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  28.57 
 
 
451 aa  161  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.95 
 
 
446 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  28.45 
 
 
438 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  31.72 
 
 
477 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  28.94 
 
 
445 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.48 
 
 
447 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  28.3 
 
 
452 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  30.04 
 
 
566 aa  146  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  31.55 
 
 
623 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  29.96 
 
 
463 aa  143  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
474 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  26.76 
 
 
499 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.17 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.17 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
399 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
399 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.91 
 
 
399 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.65 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.65 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.65 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.65 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
451 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  27.31 
 
 
663 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  30.45 
 
 
458 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  30.45 
 
 
458 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  29.55 
 
 
729 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  28.8 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.32 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.79 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.79 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.79 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.79 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.79 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  29.89 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  28.64 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.43 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
456 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
404 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  25.81 
 
 
434 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.43 
 
 
438 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.7 
 
 
443 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25 
 
 
443 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  27.09 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  27.94 
 
 
458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00217  phosphate permease (AFU_orthologue; AFUA_5G01320)  26.9 
 
 
443 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00909973  normal  0.554157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.86 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.12 
 
 
457 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.55 
 
 
455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.47 
 
 
472 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.68 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.32 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.32 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.32 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  26.52 
 
 
459 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
472 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.27 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  27.15 
 
 
403 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  27.42 
 
 
663 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  28.14 
 
 
493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  24.04 
 
 
456 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>