More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1543 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  100 
 
 
382 aa  740    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  67.02 
 
 
381 aa  476  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  59.57 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  59.31 
 
 
382 aa  391  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 
398 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  41.84 
 
 
399 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 
398 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  41.84 
 
 
399 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  42.09 
 
 
399 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
399 aa  288  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  41.79 
 
 
399 aa  288  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
399 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
399 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
399 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
399 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
399 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  41.33 
 
 
399 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  41.12 
 
 
477 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  36.3 
 
 
447 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
451 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
404 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 
435 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
445 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  35 
 
 
459 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  36.7 
 
 
388 aa  223  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
380 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  37.01 
 
 
438 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  36.94 
 
 
449 aa  203  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  35.71 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.4 
 
 
459 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 
456 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.17 
 
 
474 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.64 
 
 
473 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.17 
 
 
474 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  32.92 
 
 
422 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.35 
 
 
455 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.17 
 
 
474 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  32.9 
 
 
437 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.1 
 
 
472 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.83 
 
 
476 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.35 
 
 
455 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.83 
 
 
474 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.24 
 
 
473 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  32.72 
 
 
509 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.79 
 
 
457 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.93 
 
 
456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.28 
 
 
526 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.33 
 
 
438 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
478 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.28 
 
 
438 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
478 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
478 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
478 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
478 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.25 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  32.8 
 
 
424 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  34.36 
 
 
464 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.1 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
465 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  34.04 
 
 
469 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
436 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
436 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  32.81 
 
 
436 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  33.24 
 
 
422 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  32.64 
 
 
436 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  32.97 
 
 
422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  33.68 
 
 
437 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.61 
 
 
468 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
450 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  28.02 
 
 
514 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  26.78 
 
 
461 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
446 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  27.05 
 
 
425 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  31.06 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
539 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
467 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
467 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  32.33 
 
 
450 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.23 
 
 
432 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  31.21 
 
 
398 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  42.71 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
432 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.43 
 
 
432 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.91 
 
 
433 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
433 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.43 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.18 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.94 
 
 
433 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.99 
 
 
432 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  30.31 
 
 
467 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.32 
 
 
402 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>