More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31573 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  100 
 
 
508 aa  1040    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02864  conserved hypothetical protein  36.54 
 
 
473 aa  288  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00040  metabolite transporter, putative  39.03 
 
 
502 aa  283  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160358  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65748  glycerophosphoinositol permease  35.56 
 
 
515 aa  270  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  33.4 
 
 
530 aa  259  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01860  phospholipid transporter, putative  32.05 
 
 
519 aa  233  6e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05549  MFS phospholipid transporter (Git1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07750)  34.51 
 
 
488 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  27.62 
 
 
663 aa  148  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  27.41 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  28.73 
 
 
729 aa  134  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  29.57 
 
 
442 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  29.57 
 
 
442 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  29.8 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  29.8 
 
 
441 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  28.42 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  29.39 
 
 
465 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  27.58 
 
 
555 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25.28 
 
 
467 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  25.73 
 
 
471 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  25.17 
 
 
442 aa  104  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  25.41 
 
 
555 aa  100  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  23.93 
 
 
460 aa  96.3  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  22.5 
 
 
663 aa  94  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  25.12 
 
 
623 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  26.28 
 
 
458 aa  90.5  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  23.26 
 
 
566 aa  90.1  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.66 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  25 
 
 
458 aa  82  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  24.62 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  27.36 
 
 
477 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.82 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  24.08 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.34 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.29 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.02 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.52 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  23.41 
 
 
403 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  23.87 
 
 
456 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  22.41 
 
 
454 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  24.36 
 
 
428 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  25 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  25 
 
 
408 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  24.61 
 
 
422 aa  60.1  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
398 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  24.75 
 
 
420 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  24.75 
 
 
420 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  24.75 
 
 
420 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  26.43 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  22.97 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01612  phosphate transporter (AFU_orthologue; AFUA_4G09210)  33.58 
 
 
664 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0276272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  22.85 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2127  major facilitator transporter  23.91 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  22.13 
 
 
464 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  26.07 
 
 
388 aa  58.2  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  25.29 
 
 
429 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  22.73 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  25.23 
 
 
437 aa  57  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  22.22 
 
 
436 aa  57  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  24.25 
 
 
420 aa  57  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  26.15 
 
 
565 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13511  dicarboxylic acid transport integral membrane protein kgtP  25.67 
 
 
449 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  23.72 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  23.5 
 
 
424 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  24.35 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  23.7 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.14 
 
 
432 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.29 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 
501 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  25.77 
 
 
565 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  25.82 
 
 
441 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.29 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 
434 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.29 
 
 
432 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.95 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  24.35 
 
 
434 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
463 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  22.04 
 
 
422 aa  53.9  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  25.25 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  25.56 
 
 
415 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  22.46 
 
 
428 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  22.61 
 
 
472 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  23.81 
 
 
428 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  25 
 
 
457 aa  53.5  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>