More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0090 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  100 
 
 
422 aa  823    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  53.65 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  53.18 
 
 
422 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  48.47 
 
 
424 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  35.23 
 
 
459 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
451 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.05 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.63 
 
 
399 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  33.41 
 
 
399 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  33.41 
 
 
399 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.66 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  33.66 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.39 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.41 
 
 
399 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
398 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  34.44 
 
 
381 aa  199  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.19 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  31.31 
 
 
436 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.65 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  32.92 
 
 
382 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
398 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  30.68 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  29.58 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  28.92 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 
473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  28.7 
 
 
436 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
456 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
447 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  28.77 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  28.44 
 
 
485 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.31 
 
 
456 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
380 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  30.75 
 
 
437 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
451 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.95 
 
 
477 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  29.24 
 
 
388 aa  170  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
435 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  30.34 
 
 
436 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
451 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 
438 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
445 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  27.83 
 
 
526 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  32.6 
 
 
449 aa  166  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.64 
 
 
468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.36 
 
 
457 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
465 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.94 
 
 
459 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
472 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.61 
 
 
472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.12 
 
 
473 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  29.84 
 
 
382 aa  155  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.92 
 
 
455 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.41 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.21 
 
 
455 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.83 
 
 
474 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  30.43 
 
 
372 aa  152  8e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.34 
 
 
476 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
470 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.16 
 
 
474 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.9 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.39 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.3 
 
 
473 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  26.58 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  27.12 
 
 
479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
463 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
467 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
467 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
467 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 
467 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  24.28 
 
 
509 aa  136  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  26.21 
 
 
467 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.18 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  25.05 
 
 
514 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.29 
 
 
464 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.1 
 
 
433 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  25.82 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  25.94 
 
 
409 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.29 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.29 
 
 
432 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.29 
 
 
432 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  25.67 
 
 
450 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  25.06 
 
 
450 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.4 
 
 
432 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.4 
 
 
433 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  26.21 
 
 
478 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
459 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>