More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13511 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13511  dicarboxylic acid transport integral membrane protein kgtP  100 
 
 
449 aa  910    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4696  General substrate transporter  71.59 
 
 
462 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5345  major facilitator superfamily transporter  67.94 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5256  major facilitator transporter  67.94 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5635  general substrate transporter  67.71 
 
 
458 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03531  dicarboxylate transport protein  61.67 
 
 
430 aa  548  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0247  General substrate transporter  62.68 
 
 
444 aa  538  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.988383  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0716  General substrate transporter  54.32 
 
 
473 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0588  major facilitator transporter  53.97 
 
 
464 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  47.45 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  47.22 
 
 
440 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  47.45 
 
 
440 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  47.45 
 
 
440 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  47.22 
 
 
441 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  47.22 
 
 
440 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  46.99 
 
 
440 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  46.76 
 
 
440 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  46.51 
 
 
440 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  46.36 
 
 
453 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  46.54 
 
 
448 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  45.66 
 
 
435 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  46.54 
 
 
448 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  45.66 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  45.92 
 
 
441 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.61 
 
 
471 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  47.76 
 
 
447 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.95 
 
 
439 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.95 
 
 
439 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  45.5 
 
 
441 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.95 
 
 
439 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  46.7 
 
 
439 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.89 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  44.52 
 
 
439 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  45.79 
 
 
435 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  41.91 
 
 
451 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  40.18 
 
 
433 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  46.57 
 
 
435 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  43.71 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  45.32 
 
 
450 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  45.32 
 
 
450 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  45.32 
 
 
450 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.32 
 
 
450 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  42.18 
 
 
451 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  45.32 
 
 
450 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  42.18 
 
 
451 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  42.33 
 
 
441 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  46.77 
 
 
634 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.39 
 
 
454 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  42.92 
 
 
440 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  40.97 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.31 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.71 
 
 
445 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  44.16 
 
 
426 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2127  major facilitator transporter  42.56 
 
 
444 aa  317  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  39.53 
 
 
434 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  45.2 
 
 
431 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  40 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.63 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.63 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  39.5 
 
 
433 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  39.95 
 
 
433 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  38.85 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  41.61 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  41.61 
 
 
433 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  40.18 
 
 
432 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  41.61 
 
 
433 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  41.36 
 
 
433 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  41.36 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.6 
 
 
434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.37 
 
 
434 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  39.81 
 
 
431 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  42.32 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.37 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  39.91 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  40.37 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.14 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.37 
 
 
434 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  40.78 
 
 
426 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1272  citrate-proton symport  40.14 
 
 
444 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414334  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  41.02 
 
 
426 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  39.91 
 
 
439 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.18 
 
 
429 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  39.3 
 
 
434 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  40.46 
 
 
434 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  39.3 
 
 
434 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  39.3 
 
 
434 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  39.3 
 
 
434 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  45.45 
 
 
430 aa  296  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  39.3 
 
 
434 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  39.3 
 
 
434 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.5 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.5 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  40.5 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.5 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  40.5 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
449 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.5 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1330  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.4 
 
 
445 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  40.71 
 
 
437 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  39.56 
 
 
436 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>