More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3990 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.5 
 
 
430 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  100 
 
 
431 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  68.14 
 
 
430 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  67.14 
 
 
441 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  66.27 
 
 
439 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  65.96 
 
 
435 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  65.72 
 
 
435 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.64 
 
 
439 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  65.17 
 
 
448 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  65.17 
 
 
448 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  64.94 
 
 
439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  66.67 
 
 
441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.64 
 
 
471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.18 
 
 
439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  66.9 
 
 
447 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  63.74 
 
 
450 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  63.74 
 
 
450 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  63.74 
 
 
634 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  63.74 
 
 
450 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  63.74 
 
 
450 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  63.38 
 
 
439 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  63.74 
 
 
450 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  60.1 
 
 
440 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  60.34 
 
 
441 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  59.86 
 
 
440 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  60.1 
 
 
440 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  59.86 
 
 
440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  59.86 
 
 
440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  59.86 
 
 
440 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  59.86 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  59.38 
 
 
440 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  58.95 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  58.95 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  58.95 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  58.95 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  58.95 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  58.95 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  58.47 
 
 
439 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  59.23 
 
 
426 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  57.92 
 
 
440 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  59.38 
 
 
453 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  58.91 
 
 
437 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  55.76 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  59.11 
 
 
426 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  58.87 
 
 
426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  57.97 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  57.97 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  57.97 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  57.97 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  58.59 
 
 
435 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  57.72 
 
 
433 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  56 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.69 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  58.19 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  56 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.14 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  56 
 
 
434 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.28 
 
 
434 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  56 
 
 
434 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  55.61 
 
 
433 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.76 
 
 
434 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  52.66 
 
 
442 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  56 
 
 
434 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  59.39 
 
 
431 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.67 
 
 
434 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.28 
 
 
434 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.14 
 
 
434 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1228  alpha-ketoglutarate permease  63.84 
 
 
355 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.67 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  56.67 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.67 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  57.89 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  56.67 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  57.18 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2127  major facilitator transporter  54.59 
 
 
444 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02481  alpha-ketoglutarate transporter  56.54 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1081  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.54 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0566171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  53.24 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02445  hypothetical protein  56.54 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2739  alpha-ketoglutarate transporter  56.54 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715904  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2254  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.24 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3823  alpha-ketoglutarate transporter  56.54 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193326  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  56.54 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1090  alpha-ketoglutarate transporter  56.54 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153199  hitchhiker  0.00390378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  55.9 
 
 
436 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.24 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.89 
 
 
454 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  54.57 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5206  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.04 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  59 
 
 
430 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0849  alpha-ketoglutarate transporter  58.31 
 
 
433 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  55.37 
 
 
433 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  54.15 
 
 
433 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  53.61 
 
 
451 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  53.61 
 
 
451 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  55.9 
 
 
435 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  56.76 
 
 
437 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.17 
 
 
429 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2950  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.33 
 
 
446 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  53.61 
 
 
451 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>