More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5345 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5635  general substrate transporter  99.34 
 
 		 458 aa  908    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5256  major facilitator transporter  100 
 
 		 458 aa  915    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5345  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 458 aa  915    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4696  General substrate transporter  69.69 
 
 		 462 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13511  dicarboxylic acid transport integral membrane protein kgtP  67.94 
 
 		 449 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0247  General substrate transporter  64.46 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.988383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03531  dicarboxylate transport protein  62.86 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0716  General substrate transporter  57.14 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0588  major facilitator transporter  55.73 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  48.04 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  49.52 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  49.76 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  49.52 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  49.52 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  49.52 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  49.52 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  50 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  49.28 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  46.04 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  46.04 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  47.96 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  44.87 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  47.1 
 
 		 448 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  47.1 
 
 		 448 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.6 
 
 		 471 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  47.6 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.51 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.51 
 
 		 439 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  44.84 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  44.84 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.26 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.52 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  44.85 
 
 		 451 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  45.24 
 
 		 439 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  46.19 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  46.37 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.33 
 
 		 445 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  46.26 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  43.86 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.92 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  43.91 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  45.8 
 
 		 634 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  45.8 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  45.8 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  45.8 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  45.8 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.8 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  41.26 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  43.61 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  44.83 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  44.74 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.77 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  44.5 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  44.5 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  44.5 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  44.25 
 
 		 433 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  43.84 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  42.09 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  44.23 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  44.1 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  44.1 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  44.1 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  44.1 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  44.1 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  44.1 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  42.92 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  43.57 
 
 		 426 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.61 
 
 		 429 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  42.25 
 
 		 433 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  44.11 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  42.06 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4345  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.1 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.446356  normal  0.0102664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1378  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.86 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.13 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  45.28 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.75 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  42.25 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.89 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2179  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5206  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.44 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.75 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  43 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  42.41 
 
 		 434 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  44.21 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1272  citrate-proton symport  42.46 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2950  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.1 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3823  alpha-ketoglutarate transporter  41.55 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6792  General substrate transporter  43.44 
 
 		 468 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  44.06 
 
 		 426 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.73 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.73 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02481  alpha-ketoglutarate transporter  41.8 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  41.8 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02445  hypothetical protein  41.8 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>