More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4411 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  99.09 
 
 		 439 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  89.12 
 
 		 441 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  88.66 
 
 		 441 aa  797    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  86.81 
 
 		 435 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  89.52 
 
 		 439 aa  812    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 439 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  98.41 
 
 		 471 aa  875    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  99.32 
 
 		 439 aa  880    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  87.04 
 
 		 435 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  71.46 
 
 		 448 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  71.46 
 
 		 448 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  71.13 
 
 		 447 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  69.7 
 
 		 439 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  68.42 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  68.42 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  68.42 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  70.26 
 
 		 634 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  68.42 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  68.42 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  65.26 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  64.48 
 
 		 439 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  65.05 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  65.05 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  63.06 
 
 		 440 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  63.7 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  63.7 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  63.7 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  63.7 
 
 		 441 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  63.22 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  63.22 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  64.59 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  61.97 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  62.44 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  62.74 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  65 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  65.64 
 
 		 431 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  65.57 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  57.7 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  56.31 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  57.54 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  58.1 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.11 
 
 		 442 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.86 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1228  alpha-ketoglutarate permease  68.84 
 
 		 355 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  56.31 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  56.54 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  56.54 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  56.54 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  56.54 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  56.54 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  55.53 
 
 		 441 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  56.43 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  55.4 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.67 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  56.67 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.67 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.72 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.43 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  58.01 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.72 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  56.24 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  56.83 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  56.24 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  56 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  57.77 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.82 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  62.72 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  56.34 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  55.22 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  55.43 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  57.96 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.26 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.58 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  53.79 
 
 		 451 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  57.88 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.45 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  56.5 
 
 		 436 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  54.53 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  58.75 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  54.84 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  54.84 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2254  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.42 
 
 		 434 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  54.48 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1272  citrate-proton symport  57 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.69 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  55.37 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2739  alpha-ketoglutarate transporter  55.01 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.715904  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.16 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02481  alpha-ketoglutarate transporter  54.78 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1081  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.78 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0566171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  54.78 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02445  hypothetical protein  54.78 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  54.34 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1090  alpha-ketoglutarate transporter  54.78 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153199  hitchhiker  0.00390378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.46 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5906  alpha-ketoglutarate transporter  57.68 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414704  normal  0.801479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>