More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03531 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03531  dicarboxylate transport protein  100 
 
 
430 aa  868    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0247  General substrate transporter  78.57 
 
 
444 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.988383  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4696  General substrate transporter  63.66 
 
 
462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13511  dicarboxylic acid transport integral membrane protein kgtP  61.67 
 
 
449 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5635  general substrate transporter  63.33 
 
 
458 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5256  major facilitator transporter  62.86 
 
 
458 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5345  major facilitator superfamily transporter  62.86 
 
 
458 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0588  major facilitator transporter  53.04 
 
 
464 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0716  General substrate transporter  53.3 
 
 
473 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  46.68 
 
 
440 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  46.93 
 
 
440 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  46.7 
 
 
440 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  46.7 
 
 
440 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  46.93 
 
 
440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  46.7 
 
 
441 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  46.7 
 
 
441 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  46.46 
 
 
440 aa  358  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  47.42 
 
 
440 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  46.45 
 
 
453 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  43.74 
 
 
439 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.97 
 
 
439 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  45.3 
 
 
448 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  45.3 
 
 
448 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.54 
 
 
430 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  44.34 
 
 
435 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.82 
 
 
439 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.74 
 
 
439 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  46.3 
 
 
447 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  44.34 
 
 
435 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.44 
 
 
445 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.34 
 
 
471 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  44.31 
 
 
451 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  43.3 
 
 
441 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  43.03 
 
 
441 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  44.73 
 
 
440 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  43.76 
 
 
451 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  43.76 
 
 
451 aa  317  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  45.39 
 
 
435 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  43.66 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  43.27 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  43.5 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  43.27 
 
 
434 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  43.11 
 
 
433 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  44.15 
 
 
430 aa  309  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  42.79 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  42.79 
 
 
634 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  42.79 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  42.79 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  42.79 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  42.79 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.96 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  43.61 
 
 
433 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  43.55 
 
 
433 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  43.55 
 
 
433 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  43.55 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.99 
 
 
434 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.99 
 
 
434 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  43.31 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  43.31 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  43.5 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.12 
 
 
454 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  44.26 
 
 
431 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  42.59 
 
 
426 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  43.36 
 
 
456 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  43.51 
 
 
434 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  43.51 
 
 
434 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  43.51 
 
 
434 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  43.51 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  43.51 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  46.47 
 
 
430 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  41.9 
 
 
436 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  43.27 
 
 
434 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  41.35 
 
 
433 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0849  alpha-ketoglutarate transporter  45.19 
 
 
433 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6792  General substrate transporter  44.92 
 
 
468 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  41.35 
 
 
432 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  41.51 
 
 
439 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.5 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.25 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  44.5 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.25 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.5 
 
 
434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3945  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.79 
 
 
452 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.25 
 
 
434 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  44.25 
 
 
434 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  42.05 
 
 
483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2127  major facilitator transporter  42.24 
 
 
444 aa  289  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  44 
 
 
437 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  44.32 
 
 
431 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  41.2 
 
 
442 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5206  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.77 
 
 
449 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  41.56 
 
 
426 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.61 
 
 
429 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.61 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2179  major facilitator transporter  39.29 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  42.31 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3823  alpha-ketoglutarate transporter  42.58 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193326  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2950  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.11 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0600932 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1081  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.58 
 
 
432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0566171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  42.58 
 
 
432 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>