More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  87.44 
 
 		 439 aa  763    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  85.94 
 
 		 441 aa  757    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  73.87 
 
 		 448 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  85.71 
 
 		 441 aa  777    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  86.77 
 
 		 471 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  87.44 
 
 		 439 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  83.18 
 
 		 439 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  98.85 
 
 		 435 aa  874    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  88.15 
 
 		 439 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  73.87 
 
 		 448 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  100 
 
 		 435 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  74.82 
 
 		 447 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  73.38 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  73.38 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  73.38 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  73.38 
 
 		 634 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  73.38 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  73.38 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  67.82 
 
 		 439 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  65.57 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2040  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1563  metabolite:proton symporter family protein  65.05 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0602  alpha-ketoglutarate permease  65.05 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0815  metabolite:proton symporter family protein  66.04 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.246218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2196  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0719  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2109  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  65.05 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  63.53 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  63.76 
 
 		 441 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  63.74 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  63.53 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  63.06 
 
 		 440 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  63.06 
 
 		 441 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  63.29 
 
 		 440 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  63.29 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  62.59 
 
 		 440 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  62.33 
 
 		 453 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  65.72 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  65.58 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  65.48 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  63.1 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  56.58 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1228  alpha-ketoglutarate permease  72.52 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  55.4 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  57.04 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  54.37 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  58.21 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  55.4 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  55.01 
 
 		 441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.15 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.53 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2030  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.4 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  55.4 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.4 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.15 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  55.4 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.77 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  59.47 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.4 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.67 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 442 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.06 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  56.5 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.42 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  55.58 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  55.32 
 
 		 426 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  56.06 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.82 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  56.5 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.06 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  56.26 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  56.03 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  56.26 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  55.21 
 
 		 433 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  54.85 
 
 		 426 aa  458  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1987  alpha-ketoglutarate/proton symporter  56.64 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.057402  normal  0.55373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  57.36 
 
 		 456 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  60.95 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  54.86 
 
 		 451 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  53.69 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  54.86 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  55.84 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.66 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1272  citrate-proton symport  57 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.97 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  54.5 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  55.17 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  54.29 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.46 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  55.98 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  55.21 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4345  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  57.21 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.446356  normal  0.0102664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02481  alpha-ketoglutarate transporter  54.76 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1081  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.76 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0566171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1378  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.97 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  54.01 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1090  alpha-ketoglutarate transporter  54.76 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153199  hitchhiker  0.00390378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2873  alpha-ketoglutarate transporter  54.76 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.764755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02445  hypothetical protein  54.76 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0849  alpha-ketoglutarate transporter  56.83 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>