More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0247 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0247  General substrate transporter  100 
 
 		 444 aa  894    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.988383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03531  dicarboxylate transport protein  78.57 
 
 		 430 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5345  major facilitator superfamily transporter  64.46 
 
 		 458 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5635  general substrate transporter  64.69 
 
 		 458 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5256  major facilitator transporter  64.46 
 
 		 458 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4696  General substrate transporter  64.97 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13511  dicarboxylic acid transport integral membrane protein kgtP  62.68 
 
 		 449 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0588  major facilitator transporter  54.5 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0716  General substrate transporter  54.84 
 
 		 473 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  48.55 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  48.18 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  48.42 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  48.31 
 
 		 441 aa  359  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  48.29 
 
 		 440 aa  358  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  48.31 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  48.07 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  48.07 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  47.58 
 
 		 441 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1540  sugar (and other) transporter  46.12 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  47.79 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  46.19 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  46.19 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3111  general substrate transporter  47.55 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0621648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.34 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  45 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  45.33 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5228  General substrate transporter  45.66 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.95 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  44.92 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  44.21 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4010  citrate-proton symport  42.86 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0166945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  44.73 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  43.85 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  43.44 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  43.44 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1559  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.22 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.32 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.34 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.59 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.34 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  43.02 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2946  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.01 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4306  dicarboxylic acid transport protein  42.47 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18040  dicarboxylate or citrate transporter (MFS superfamily)  43.9 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  45.24 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0075  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  43.17 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  45.24 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  45.24 
 
 		 634 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.24 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  45.24 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  45.24 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5622  General substrate transporter  43.9 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  43.2 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2127  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 444 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  42.96 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3990  General substrate transporter  47.41 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341407  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1863  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175149  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  43.82 
 
 		 432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0761  General substrate transporter  43.43 
 
 		 430 aa  305  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5495  citrate-proton symport  43.19 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2466  alpha-ketoglutarate permease  41.65 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2256  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24940  metabolite:proton symporter protein  43.19 
 
 		 426 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3844  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.12 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3958  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.12 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.698828  normal  0.0345957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1167  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 483 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181603  normal  0.0337638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1531  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.65 
 
 		 434 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1018  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.62 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4436  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.83 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.939154  hitchhiker  0.00699938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1513  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.18 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4345  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.07 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.446356  normal  0.0102664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3340  alpha-ketoglutarate transporter  42.2 
 
 		 426 aa  295  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1378  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.83 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4754  citrate-proton symporter, (MFS_1)  41.71 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0236627  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5206  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.74 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2866  alpha-ketoglutarate transporter  40.05 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2848  alpha-ketoglutarate transporter  40.05 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2764  alpha-ketoglutarate transporter  40.65 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2982  alpha-ketoglutarate transporter  40.05 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2870  alpha-ketoglutarate transporter  40.65 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1136  metabolite  41.71 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1592  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.71 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.594462  normal  0.64076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1616  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.71 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0883  alpha-ketoglutarate transporter  43.95 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.103256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1330  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.05 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.481806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3751  alpha-ketoglutarate transporter  41.4 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.129946  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.69 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3496  alpha-ketoglutarate transporter  41.95 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3945  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.44 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5906  alpha-ketoglutarate transporter  42.15 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414704  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1622  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.23 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.809849  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2950  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.97 
 
 		 446 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0817  dicarboxylic acid transporter PcaT  41.41 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0344  alpha-ketoglutarate permease  41.41 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1688  alpha-ketoglutarate permease  41.41 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1272  citrate-proton symport  42.12 
 
 		 444 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1865  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  41.41 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1877  alpha-ketoglutarate permease  41.41 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>