More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1414 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  832    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  54.05 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  38.31 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  38.55 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  38.31 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  38.31 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  33.79 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  33.79 
 
 		 436 aa  222  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 451 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  29.32 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  32.44 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.7 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  31.09 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 380 aa  196  9e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 451 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 436 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.09 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.41 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  31.16 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.18 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.7 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.7 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.77 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.7 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.7 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.7 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 473 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 372 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  32.13 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.79 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 474 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 473 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.93 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.38 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  29.34 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 514 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.66 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.28 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.36 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  29.51 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 446 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 450 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.23 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 458 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  27.01 
 
 		 446 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>