More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0623 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0623  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
425 aa  814    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  48.45 
 
 
421 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 
444 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  37.15 
 
 
442 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  33.57 
 
 
437 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  34.32 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  34.94 
 
 
428 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  36.13 
 
 
448 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  31.45 
 
 
433 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  30.96 
 
 
433 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  32.78 
 
 
454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  31.2 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  30.96 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  31.37 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  30.96 
 
 
436 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  31.37 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  30.96 
 
 
433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 
446 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  29.98 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  31.15 
 
 
450 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  31.38 
 
 
450 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
439 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
458 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
439 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  34.32 
 
 
456 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  31.19 
 
 
452 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 
451 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  35.03 
 
 
446 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
455 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  32.38 
 
 
456 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  34.6 
 
 
445 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  33.74 
 
 
458 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  30.99 
 
 
436 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  31.9 
 
 
452 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  31.31 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  33.64 
 
 
454 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  33.42 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  32.87 
 
 
442 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
433 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  32.63 
 
 
442 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  32.04 
 
 
407 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
455 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  32.62 
 
 
440 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  32.7 
 
 
442 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  33.5 
 
 
443 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  32.71 
 
 
446 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  32.09 
 
 
446 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.93 
 
 
401 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.75 
 
 
406 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
463 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.16 
 
 
441 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  28.44 
 
 
452 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4137  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  31.72 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  38.35 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
435 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  29.7 
 
 
454 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  28.93 
 
 
438 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  29.36 
 
 
452 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  27.53 
 
 
452 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.28 
 
 
454 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  34.39 
 
 
401 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  34.39 
 
 
401 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  32.54 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  30.02 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  29.92 
 
 
452 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.56 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  33.8 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  29.92 
 
 
452 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  33.61 
 
 
401 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  32.88 
 
 
403 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  32.88 
 
 
403 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  32.88 
 
 
403 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.88 
 
 
403 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  34.5 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.47 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.88 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.88 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.88 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  33.04 
 
 
413 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.88 
 
 
403 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  29.23 
 
 
435 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  27.06 
 
 
452 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  30.26 
 
 
453 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  27.53 
 
 
452 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.12 
 
 
449 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  29.74 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  29.72 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  29.74 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  29.74 
 
 
453 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  30.63 
 
 
530 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  29.95 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  29.95 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  29.77 
 
 
451 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  29.77 
 
 
451 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  29.57 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>