More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6367 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  85.57 
 
 		 414 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  780    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  64.91 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  63.17 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  57.68 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  56.2 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  59.79 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  59.84 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  60.41 
 
 		 416 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  60.65 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  53.94 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.1 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  27.06 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.04 
 
 		 429 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.05 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.21 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 442 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.61 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.79 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 400 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.2 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  25 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.62 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  23.96 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.53 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  21.26 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.81 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  24.4 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  25.27 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  28.84 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  26.76 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>