166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37914 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  100 
 
 
421 aa  834    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  38.24 
 
 
454 aa  267  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  36.99 
 
 
453 aa  263  6e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  32.95 
 
 
439 aa  249  8e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  36.47 
 
 
471 aa  249  9e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  37.32 
 
 
510 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  33.93 
 
 
432 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  32.07 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
448 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  30.4 
 
 
436 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  31.07 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  30.89 
 
 
437 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  32.08 
 
 
482 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  29.95 
 
 
1072 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  28.57 
 
 
429 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  32.77 
 
 
442 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 
443 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  28.93 
 
 
453 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189229 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  30.29 
 
 
463 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  29.53 
 
 
606 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  26.1 
 
 
539 aa  95.9  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  24.33 
 
 
506 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  22.65 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  21.11 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  25.88 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.49 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.36 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.14 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.06 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.21 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  25 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  23.65 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.07 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  23.66 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  24.02 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  21.66 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  24.04 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  24.75 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  25 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  23.31 
 
 
411 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
416 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  24.86 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  34.02 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  22.61 
 
 
523 aa  61.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 
417 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  19.16 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 
441 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  21.6 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  21.84 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.46 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  21.52 
 
 
528 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  20.78 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02591  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14260)  24.58 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0146551  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  21.41 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  19.02 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  22.42 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.13 
 
 
426 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  22.08 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  19.02 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  22.42 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  21.35 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  18.71 
 
 
429 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  23.15 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 
414 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  20.66 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  23.94 
 
 
495 aa  53.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  23.1 
 
 
449 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  26.32 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  23.46 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  21.37 
 
 
434 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  23.37 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  20.71 
 
 
404 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  22.32 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  22.5 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  23.08 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  20.74 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
430 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  22.92 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  22.78 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>