More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2178 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  100 
 
 
495 aa  988    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  62.13 
 
 
503 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  60.41 
 
 
531 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  60 
 
 
489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  61.91 
 
 
503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  61.95 
 
 
489 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  63.11 
 
 
493 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  62.58 
 
 
552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  62.2 
 
 
496 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  64.44 
 
 
495 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1596  putative proline/betaine transporter  64.59 
 
 
628 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  60.47 
 
 
489 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  64.44 
 
 
495 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  64.44 
 
 
495 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  64.59 
 
 
626 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  64.44 
 
 
534 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  60.47 
 
 
489 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  64.44 
 
 
495 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  64.44 
 
 
534 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  60.25 
 
 
489 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  63.11 
 
 
491 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  63 
 
 
527 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  62.47 
 
 
495 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  62.42 
 
 
496 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5572  general substrate transporter  62.17 
 
 
488 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1491  general substrate transporter  61.32 
 
 
489 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156712  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  56.59 
 
 
500 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  62.44 
 
 
452 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  55.29 
 
 
501 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  52.83 
 
 
500 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  53.04 
 
 
500 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  53.26 
 
 
500 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  53.26 
 
 
500 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  53.26 
 
 
500 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  52.83 
 
 
500 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  52.39 
 
 
500 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.39 
 
 
500 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  52.39 
 
 
500 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  53.25 
 
 
500 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  52.17 
 
 
500 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  52.39 
 
 
500 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  52.92 
 
 
500 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  52.39 
 
 
500 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  53.25 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  53.03 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  53.03 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  53.12 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  54.61 
 
 
493 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  49.06 
 
 
485 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  49.06 
 
 
485 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  49.06 
 
 
485 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  49.48 
 
 
483 aa  458  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  49.06 
 
 
485 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  50.11 
 
 
485 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  49.89 
 
 
485 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  49.06 
 
 
485 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  48.85 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  49.27 
 
 
485 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  47.63 
 
 
482 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  53.24 
 
 
454 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0291  general substrate transporter  45.57 
 
 
530 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  55.02 
 
 
430 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  53.94 
 
 
481 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  51.77 
 
 
444 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2166  General substrate transporter  51.9 
 
 
495 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.734209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0518  General substrate transporter  44.47 
 
 
526 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  49.06 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  49.08 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  49.06 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  49.06 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.53 
 
 
445 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  49.07 
 
 
453 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  45.95 
 
 
467 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  47.21 
 
 
463 aa  382  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  45.31 
 
 
465 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0223  major facilitator family transporter  44.54 
 
 
464 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0596  major facilitator transporter  45.84 
 
 
466 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  45.31 
 
 
472 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0610  major facilitator transporter  45.84 
 
 
466 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1065  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 
502 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18730  arabinose efflux permease family protein  45.05 
 
 
480 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.635364  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  47.36 
 
 
461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6159  general substrate transporter  47.12 
 
 
461 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5794  general substrate transporter  47.12 
 
 
461 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390402  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6031  general substrate transporter  47 
 
 
461 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5788  general substrate transporter  46.76 
 
 
461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  43.36 
 
 
450 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  44.47 
 
 
467 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  42.49 
 
 
444 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  42.36 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  44.52 
 
 
445 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  44.52 
 
 
441 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  44.13 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2381  general substrate transporter  45 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.841245  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  44.76 
 
 
436 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  44.76 
 
 
436 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  44.76 
 
 
436 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4266  general substrate transporter  43.65 
 
 
435 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  41.75 
 
 
456 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1075  general substrate transporter  43.71 
 
 
446 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>