More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2878 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  100 
 
 
459 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  87.82 
 
 
420 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  86.1 
 
 
423 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  86.1 
 
 
423 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  84.95 
 
 
439 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  85.52 
 
 
424 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  84.88 
 
 
422 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  64.65 
 
 
430 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
408 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  35.76 
 
 
413 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  35.96 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.61 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  31.48 
 
 
434 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.9 
 
 
400 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.54 
 
 
486 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.47 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
413 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  27.79 
 
 
430 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.4 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.47 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  29.93 
 
 
412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.04 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  30.42 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.11 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.74 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  28.88 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.37 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  30.53 
 
 
424 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.85 
 
 
427 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.76 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.83 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.81 
 
 
408 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.1 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.82 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
405 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.95 
 
 
428 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.38 
 
 
394 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  28.3 
 
 
427 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.62 
 
 
405 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
428 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
452 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
442 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.79 
 
 
397 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.65 
 
 
436 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.4 
 
 
414 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  26.89 
 
 
422 aa  107  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  28.36 
 
 
414 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  32.65 
 
 
432 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
407 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
407 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
405 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
422 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  25.46 
 
 
439 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
424 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.43 
 
 
452 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.43 
 
 
420 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.13 
 
 
430 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  27.29 
 
 
432 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.92 
 
 
408 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  28.44 
 
 
427 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.15 
 
 
411 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.15 
 
 
411 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.79 
 
 
431 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.64 
 
 
408 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  29.27 
 
 
427 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
472 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  28.35 
 
 
427 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
405 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.19 
 
 
410 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.72 
 
 
427 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.57 
 
 
442 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
431 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  30.47 
 
 
442 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  24.87 
 
 
402 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  25.67 
 
 
510 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  28.61 
 
 
427 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.12 
 
 
404 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.64 
 
 
402 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.04 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  24.61 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  24.35 
 
 
402 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  26.82 
 
 
418 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  28.35 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  28.35 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  28.35 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.19 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  28.35 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  28.35 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  28.35 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28.07 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
411 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>