189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04160 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  100 
 
 
360 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.79 
 
 
506 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  24.38 
 
 
487 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  25.96 
 
 
437 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  28.21 
 
 
463 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27 
 
 
424 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.01 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  22.39 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 
442 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.43 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  24.72 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.19 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  23.31 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.49 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.62 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  25.74 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.41 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.41 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.41 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  24.79 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  24.57 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.41 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  24.04 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.41 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.41 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.41 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.41 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  24.93 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  24.93 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  27.39 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  22.22 
 
 
429 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  25.19 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  24.14 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  22.96 
 
 
471 aa  73.2  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  25.66 
 
 
523 aa  72.8  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 
448 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  26.03 
 
 
606 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  24.09 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  25.82 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  25.72 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  22.86 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  21.7 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.28 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  24.09 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  25.45 
 
 
485 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  26.69 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.94 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  26.38 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.92 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  23.42 
 
 
442 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  25.55 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  24.13 
 
 
394 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.71 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
436 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  24.52 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  22.1 
 
 
539 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  24.35 
 
 
447 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 
437 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  24.14 
 
 
432 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
431 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  23.97 
 
 
410 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  23.41 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  22.83 
 
 
1072 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  21.95 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.4 
 
 
418 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  23.57 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  27.79 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.24 
 
 
418 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  23.79 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  22.61 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  23.66 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  22.61 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  26.19 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  21.97 
 
 
402 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  22.29 
 
 
402 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  25.26 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  25.7 
 
 
415 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  24.44 
 
 
447 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  22.29 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>