188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60420 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  100 
 
 		 606 aa  1234    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  28.99 
 
 		 485 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  31.76 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  28.06 
 
 		 523 aa  186  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  28.78 
 
 		 410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  28.96 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  30.17 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  26.46 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  28.17 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  28.61 
 
 		 482 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 431 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189229 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  23.8 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 442 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  29.53 
 
 		 421 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 		 428 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  25 
 
 		 463 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  24.38 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  26.83 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 448 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  26.72 
 
 		 445 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  25.81 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  25 
 
 		 432 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  22.67 
 
 		 539 aa  90.5  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  24.8 
 
 		 450 aa  89.7  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  24.68 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 		 358 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  26.86 
 
 		 1072 aa  87.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  23.66 
 
 		 447 aa  86.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  25 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  23.83 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  25.21 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  24.3 
 
 		 453 aa  77  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  24.28 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  25.48 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02591  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14260)  22.99 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0146551  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  25.81 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  25.75 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  23.48 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 430 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3891  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 404 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.42 
 
 		 430 aa  54.7  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 430 aa  53.9  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 400 aa  53.9  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25 
 
 		 430 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 414 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  24.01 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  23.93 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 422 aa  53.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 		 433 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  31.47 
 
 		 435 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 420 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.42 
 
 		 429 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 421 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 433 aa  50.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 436 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 442 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 457 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  26.03 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 413 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  23.51 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  26.37 
 
 		 216 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  22.68 
 
 		 407 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>