273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3053 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  100 
 
 		 435 aa  866    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  53.12 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.27 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.06 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  22.55 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  20.53 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  23 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  23 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  23 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  23 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  23 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  21.69 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  23 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.82 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  23.96 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  24.77 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  20.26 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  20.67 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  25.81 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.54 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.54 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.54 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  23.79 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  24.16 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  23.8 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  23.1 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  23.04 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  23.1 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.1 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  23.1 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  23.1 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  23.35 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  21.31 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  24.09 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 436 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  24.12 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>