More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5881 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
404 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  93.53 
 
 
404 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  77 
 
 
400 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  65.89 
 
 
413 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  56.93 
 
 
402 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  55.78 
 
 
411 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  56.14 
 
 
408 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  54.57 
 
 
410 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  55.53 
 
 
411 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  55.53 
 
 
411 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  54.36 
 
 
409 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  56.17 
 
 
405 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  55.44 
 
 
410 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 
402 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
417 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
419 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  34.36 
 
 
394 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  30.73 
 
 
414 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  32.21 
 
 
412 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  29.11 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  32.01 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.48 
 
 
412 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  31.17 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.23 
 
 
434 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  32.21 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
405 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.43 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.68 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.43 
 
 
414 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
409 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.88 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.32 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  28.82 
 
 
411 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.81 
 
 
410 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
408 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.2 
 
 
423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.2 
 
 
423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  28.88 
 
 
413 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.8 
 
 
422 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.35 
 
 
424 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
416 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  27.67 
 
 
412 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.81 
 
 
412 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
411 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27 
 
 
402 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.12 
 
 
418 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  29.18 
 
 
415 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  26.7 
 
 
411 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.46 
 
 
439 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.89 
 
 
420 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
425 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  31.01 
 
 
410 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.92 
 
 
398 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.05 
 
 
410 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  25.65 
 
 
506 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  25.82 
 
 
528 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  23.73 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.02 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.02 
 
 
430 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
421 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.77 
 
 
430 aa  96.3  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.78 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.63 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  28.21 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.25 
 
 
457 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  27.37 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
421 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  31.02 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  22.98 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  25.57 
 
 
405 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  25.2 
 
 
404 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
432 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  27.24 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.47 
 
 
398 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  27.54 
 
 
415 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.57 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.47 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  26.26 
 
 
442 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.46 
 
 
427 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  26.27 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  25.82 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.48 
 
 
430 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.77 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  25.55 
 
 
417 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>