More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1300 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  84.67 
 
 
408 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  83.41 
 
 
411 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  83.9 
 
 
411 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  83.74 
 
 
409 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  83.41 
 
 
411 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  83.17 
 
 
405 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  71.85 
 
 
402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  69.08 
 
 
402 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  71.32 
 
 
410 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  58.4 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  54.99 
 
 
413 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 
404 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 
404 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
409 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  30.18 
 
 
412 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  28.83 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  29.44 
 
 
416 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  29.87 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
430 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  29.58 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  29.02 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.95 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.53 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  30.4 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  29.82 
 
 
439 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  30.89 
 
 
424 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.13 
 
 
434 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 
423 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.53 
 
 
423 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
409 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.97 
 
 
422 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.17 
 
 
414 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.35 
 
 
452 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
452 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.12 
 
 
402 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.1 
 
 
430 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  27.29 
 
 
411 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  26.7 
 
 
413 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
434 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.24 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
405 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.52 
 
 
422 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
442 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.68 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  27.13 
 
 
528 aa  87  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
421 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
417 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.78 
 
 
408 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.24 
 
 
421 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.75 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  31.25 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.9 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  27.83 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.77 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  27.43 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  29.37 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  22.19 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.73 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.06 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  26 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.43 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  25.35 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.65 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  29.37 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.79 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.04 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  21.96 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.79 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.07 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  22.16 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  21.96 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  24.75 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  22.22 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  26.27 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.14 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  26.42 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  29.24 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  21.96 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  21.96 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  24.55 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  21.05 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  21.96 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  21.96 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.73 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  21.96 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>