More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0180 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  61.21 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 486 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  39.02 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  31.25 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  32.99 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 433 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  30.83 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 405 aa  99.8  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  27.27 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  30.63 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  22.92 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 404 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 431 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  27.92 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.62 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  29.53 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.59 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.53 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.35 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.9 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.67 
 
 		 429 aa  93.6  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  27.47 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 431 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 457 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.89 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  27.91 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 413 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.92 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>