More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37460  putative permease  100 
 
 		 427 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  59.84 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  29.62 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 422 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  26.93 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  29.18 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.33 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  26.65 
 
 		 421 aa  89.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.43 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 431 aa  86.3  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.31 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.89 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  28 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  26.44 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.06 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.98 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  27.9 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  30.04 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  26.4 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.45 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  26.54 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>